Program Pascasarjana Universitas 17 Agustus 1945 Surabaya didirikan pada tahun 1991 dengan dua program studi, yaitu Program Studi Master of Business Administration (MBA), dan Program Studi Master of Public Administration (MPA).
Berdasarkan SK Dirjen Dikti Depdikbud RI Nomor 269/DIKTI/Kep/1993, Program Pascasarjana Untag Surabaya telah diijinkan untuk membuka Program Studi Magister Manajemen (MM) dan Program Studi Magister Ilmu Administrasi (MA).
Pada tahun 1998 berdasarkan SK Dirjen Dikti No. 341/DIKTI/Kep/ 1998 telah dibuka untuk Program Studi Magister Ilmu Hukum. Selanjutnya pada tahun 1999 berdasarkan SK Dirjen Dikti No. 210/DIKTI/Kep/1999 Program Pascasarjana diijinkan untuk mendirikan Program Magister Psikologi.
Pada tahun 2000 program studi Magister Manajemen dan program Studi Magister Ilmu Administrasi dilakukan akreditasi ulang oleh Badan Akreditasi Nasional (BAN), berdasarkan SK BAN No. 00239/AK/-1-25/U1 SMAP/IX/2000 untuk program Studi Magister Ilmu Administrasi telah terakreditasi Unggulan (U), sedang kan Program Studi Magister Manajemen berdasarkan SK BAN No.00239/AK/-1-25/U1 SMAP/IX/2000 terakreditasi Belajar (B)
Pada tahun 2000 Program Pascasarjana Untag Surabaya dipercaya oleh Direktorat Jendral Pendidikan Tinggi, sebagai universitas pertama di Jawa Timur yang mengelola Program Doktor, yaitu berdasarkan SK 205/Dikti/Kep/2000. Program yang dimiliki adalah:
Program Doktor Ilmu Ekonomi
Program Doktor Ilmu Administrasi
Program Doktor Ilmu Hukum
